Emiya Shirō (衛宮 士郎 Emiya Shirō) :
Shirō est le personnage principal de l'histoire. C'est un adolescent honnête, sérieux, très travailleur et toujours prêt à aider. Ses principaux hobbies sont la réparation d'objets cassés, mais également la cuisine et le ménage.
Il possède quelques pouvoirs latents en sorcellerie, ceci s'étant développés sous l'égide de son père adoptif, Kiritsugu Emiya. Au départ, il refuse de participer à la Guerre du
Saint-Graal et tente désespérément de protéger les autres du danger, y comprit son propre Servant , Saber
Tōsaka Rin (遠坂 凛 Tōsaka Rin) :
Élève modèle et idole de l'école de Shirō, Rin Tōsaka garde secret ses talents de magicienne. Descendante d'une longue lignée de sorciers, elle n'a pu bénéficier de l'entraînement habituelle de sa famille, son père ayant été tué durant la précédente guerre du Graal.
Bien que très douée, elle tenta d'appeler un Servant de type Saber mais se retrouva
finalement alliée à Archer.
Ilyasviel von Einzbern (イリヤスフィール・フォン・アインツベルン Iriyasufīru fon Aintsuberun) :
Une jeune aristocrate Allemande, elle voyage à travers le Japon pour participer à la Guerre du Saint-Graal en tant que Master. Illyasviel à une apparence angélique et possède d'importants pouvoir magiques.
Elle vit dans un château sur les hauteurs de Fuyuki, en compagnie de son Servant et de deux domestiques. Illyasviel à pour habitude de demander à ceux avec qui elle s'entend bien de l'appeler simplement "Ilya".
Matō Shinji (間桐 慎二 Matō Shinji) :
C'est le grand frère de Sakura, et un ami de longue date de Shiro. Shinji est le très populaire vice-capitaine du club de tir à l'arc, malgré le fait qu'il soit chauvin et narcissique.
Tout comme Rin ōsaka, il descend d'une longue lignée de sorciers, bien que le sang
des Matōs se soit appauvrie et qu'il ne puisse plus engendrer d'héritier naturellement doué en sorcellerie. Shinji n'apprécie pas les visites quotidiennes de sa sœur dans la résidence de Shiro. Il a des sentiments pour Rin, mais ceux-ci ne sont pas réciproques.
Matō Zōken (間桐 臓硯 Matō Zōken) (seulement dans Heavens Feel) :
Zōken est un perspicace, puissant, et ancien sorcier ainsi que le patriarche de la famille Matō et de facto le grand-père de Shin et Sakura. Au cours des années, il a amassé une impressionnante collection de livres de sorcellerie, et ses leçons sont dispensées de manière stricte et sévère.
Zōken considère Shinji comme un sorcier de seconde catégorie, et pense que Sakura à plus de potentielle que son frère .